بحثت أطروحة دكتوراه في كلية العلوم بجامعة البصرة عزل وتشخيص الفطريات الداخلية وتقدير تأثيرها وأيضها الثانوي على بعض الفطريات الممرضة لمحصول الحنطة.
وتهدف الرسالة الطالبة التي قدمتها آلاء علاء الدين، إلى معرفة أنواع الفطريات الداخلية في 20 نوعاً نباتياً.
وبينت الاطروحة قابلية هذه الفطريات في تحسين الصفات الحيوية للنبات وحمايته من الأمراض اذ تُعد الفطريات الداخلية للنبات Endophytic fungi مجموعة من الفطريات المجهرية التي تستعمر وتنمو داخل النباتات السليمة في كل أو جزء من دورة حياتها دون أن تُسبب أي مرض أو ضرر واضح للمضيف.
وأظهرت نتائج الاطروحة ان عمليات التحليل الجيني تمكنت من تسجيل (30) نوعاً فطرياً جديداً لأول مرة في العراق.